İnsanlar arası fekal – oral denen bulaş yolu yani doşkı yoluyla ağızdan bulaşır. Ağızdan alınan kirli su ve besinler sindirim sisteminde ameboid-vakuol-granüler dönüşümünü yapar. Dışkıda kistlerin görülmesi tanı koydurucudur. Bu kistler 5-32 pikometre arasında değişen boyutlardadır.  Blastocystis spp. vakuoler yapısı merkezde vakuol ve kenarlarda nükleus yani çekirdek yapısına sahip bir hücre yapısına sahiptir.